Pondok Pesantren Hidayatullah Surabaya merupakan lembaga pendidikan Islam yang berdiri sejak tahun 1994 dan berkembang sebagai bagian dari jaringan pendidikan Hidayatullah. Pesantren ini menyelenggarakan pendidikan formal dan nonformal berbasis nilai tauhid dengan jenjang pendidikan mulai dari PAUD hingga perguruan tinggi melalui Lembaga Pendidikan Luqman Al Hakim. Berlokasi di wilayah Mulyorejo, Surabaya, pesantren ini berfokus pada pembinaan akhlak, karakter, dan keilmuan santri berdasarkan Al-Qur’an dan Sunnah, serta memiliki peran dalam kegiatan pendidikan dan dakwah di masyarakat.

Pondok Pesantren Hidayatullah Parepare merupakan lembaga pendidikan dan dakwah Islam yang berlokasi di Kota Parepare, Sulawesi Selatan. Pesantren ini berfokus pada pembinaan kader umat melalui pendidikan, dakwah, sosial, dan penguatan komunitas Islami dengan prinsip Al Wasathiyah. Dengan visi membangun peradaban Islam, Hidayatullah Parepare menjalankan misi melahirkan kader berkualitas, membangun komunitas Islami, serta bersinergi dengan berbagai elemen umat dan bangsa dalam upaya amar ma’ruf nahi munkar dan pembaharuan pemikiran Islam.

Pondok Pesantren Modern Hidayatullah Blitar merupakan lembaga pendidikan Islam yang berlokasi di Kecamatan Sananwetan, Kota Blitar, Jawa Timur. Didirikan pada tahun 2022, pesantren ini menyelenggarakan pendidikan dan pembinaan keislaman dengan fokus pada pembelajaran Al-Qur’an, pendalaman ilmu-ilmu keislaman, penguatan Bahasa Arab, serta pembinaan akhlak dan karakter santri dalam lingkungan pesantren modern.

MTs–MA Hidayatullah Yogyakarta merupakan lembaga pendidikan Islam setingkat madrasah tsanawiyah dan aliyah yang berlokasi di Kabupaten Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta. Lembaga ini menyelenggarakan pendidikan berbasis pesantren dengan pendekatan pendidikan holistik dan integral yang memadukan aspek ruhiyah, jasmaniyah, dan aqliyah, serta menekankan penguatan karakter, intelektual, dan kesiapan santri dalam menghadapi kehidupan